1、地方財力不足

分稅制財政體制改革實(shí)施以來(lái)，地方財政實(shí)力雖然得到了逐年較大幅度的增長(cháng)，但相對于不斷膨脹的剛性財政支出來(lái)說(shuō)，仍然是入不敷出。每年新增長(cháng)的財力除保工資、保運轉、保穩定、保重點(diǎn)支出外，所剩無(wú)幾。‘盡管中央和省級政府近年來(lái)加大了對縣鄉政府、尤其是經(jīng)濟欠發(fā)達地區縣鄉政府的財政轉移支付力度，但這些轉移支付絕大多數具有專(zhuān)項用途，并沒(méi)有明顯增加縣鄉政府可統籌安排使用的財力。

2、管理體制不順

目前我國農村中小型水利工程管理沿用的基本上還是計劃經(jīng)濟體制下的管理體制，水利設施產(chǎn)權不明，水利工程管理體制不順，管理單位機制不活，水利工程運行管理和維修養護經(jīng)費不足，供水價(jià)格形成機制不合理，國有水利經(jīng)營(yíng)性資產(chǎn)管理運營(yíng)體制還很不完善。同時(shí)，由于我國農村水利建設長(cháng)期以來(lái)一直靠政府號召、政策引導、行政力量組織的方式開(kāi)展，缺乏相應的法律規范，許多重大體制問(wèn)題一直缺乏清晰的政策界線(xiàn)，如政府、農民、社會(huì )力量三者之間的責、權、利關(guān)系；已建成工程設施的資產(chǎn)監管和產(chǎn)權歸屬，公益性設施運行損耗和政策性經(jīng)營(yíng)虧損補償、工程的管護責任如何落實(shí)等等。這些問(wèn)題不僅導致大量水利工程得不到正常的維修養護，效益嚴重衰減，而且最終影響到農田水利在促進(jìn)農業(yè)增效、農民增收方面應有作用的發(fā)揮。

3、監管機制弱化

目前在我國對財政資金使用效益的績(jì)效評價(jià)機制雖已啟動(dòng)，但還只是在探索運行階段，對一些較大財政項目的績(jì)效評價(jià)工作尚不能全面深入地開(kāi)展，就更談不到對眾多中小型農田水利基本建設項目的績(jì)效評價(jià)了。由于缺乏績(jì)效評價(jià)機制，水利工程審報、批準和承辦的單位或人員就少了一份壓力，干好干壞一個(gè)樣，效益好壞一個(gè)樣，這樣便導致了一些“人情項目”、“關(guān)系項目”的屢禁不止，也使一些“豆腐渣”工程的責任制造者逃脫了行政責任、以至法律責任的追究。