通常合同分析首先針對具體的合同條款（或合同結構中的子項）。根據它的表達方式，分析它的執行將會(huì )帶來(lái)什么問(wèn)題和后果。在此基礎上還應注意合同條款之間的內在聯(lián)系。同樣一種表達方式，在不同的合同環(huán)境中，有不同的上下文，則可能有不同的風(fēng)險。

由于合同條款所定義的合同事件和合同問(wèn)題具有一定的邏輯關(guān)系（如實(shí)施順序關(guān)系，空間上和技術(shù)上的互相依賴(lài)關(guān)系，責任和權力的平衡和制約關(guān)系，完整性要求等），使得合同條款之間有一定的內在聯(lián)系，共同構成一個(gè)有機的整體，即一份完整的合同。例如：

有關(guān)合同價(jià)格方面的問(wèn)題涉及：合同計價(jià)方法、量方程序、進(jìn)度款結算和支付、保留金、預付款、外匯比例、竣工結算和最終結算、合同價(jià)格的調整條件、程序、方法等。

工程變更問(wèn)題涉及：工程范圍，變更的權力和程序，有關(guān)價(jià)格的確定，索賠條件、程序、有效期等。

它們之間互相聯(lián)系，構成一個(gè)有機的整體。通過(guò)內在聯(lián)系分析可以看出合同中條款之間的缺陷、矛盾、不足之處和邏輯上的問(wèn)題等。