由于工程量清單的項目特征描述不夠全面完整，選用的材料品牌規格不夠明確、結算時(shí)可能的單價(jià)調整方式約定不夠詳細。使投標企業(yè)對項目的判斷和綜合價(jià)格的組成在理解上有誤或差異。造成施工合同不能很好地滿(mǎn)足合同雙方的真實(shí)意思表現。

實(shí)行工程量清單招標以后，簽訂的合同為單價(jià)合同，不再把定額作為計價(jià)基礎，主要以中標的投標單價(jià)為依據。但工程實(shí)際往往與清單描述有差異，對報價(jià)表中沒(méi)有相應價(jià)格或需調整的價(jià)格，及索賠的價(jià)格等如何確定，很多施工合同未能詳細約定，僅僅是模糊的幾點(diǎn)原則，因此成為合同簽訂的一個(gè)重要問(wèn)題。

工程量的錯誤或變更還會(huì )引起施工索賠糾紛，由于工程量清單的計價(jià)方式是將各種利潤、管理費等計入綜合單價(jià)中，

如工程量大幅減少，施工方會(huì )提出利潤、管理費等不能同比例減少的要求。如“增加的工程量/因此而增加的施工工期”少于“合同工程量/合同工期”，則施工方又會(huì )提出增加現場(chǎng)管理費的請求。盡管施工合同一般約定工程量增加或減少超過(guò)15%時(shí)，綜合單價(jià)予以調整，但如何調整也是工程結算時(shí)發(fā)生糾紛的起因之一。

工程量錯誤的不平衡報價(jià)及調高先付款項目調低后付款項目的不平衡報價(jià)等使承包人獲取了超額利潤，但同時(shí)也造成了業(yè)主的損失，不能體現合同的公平與合理。