由于圖紙變更及編制人員水平差等原因，經(jīng)常會(huì )造成實(shí)際結算工程量與招標清單工程量相差較大，最終結算價(jià)與投標價(jià)相差甚遠。

由于設計變更等原因造成原清單報價(jià)需作調整，一般的施工合同約定是在投標單價(jià)基礎上按原報價(jià)水平及思路作調整，但也常常因原投標報價(jià)時(shí)綜合單價(jià)存在錯誤而使調整后的綜合單價(jià)“錯上加錯”。

由于編制人員的水平或責任心等原因，造成清單的項目特性描述不清或欠準確，造成理解上的差錯，如特性描述中漏寫(xiě)部分說(shuō)明，業(yè)主或審計單位一般會(huì )認為應按常規考慮，未詳細列出的施工內容已經(jīng)（或應該）包含在清單的綜合單價(jià)中，而施工單位則會(huì )認為應嚴格按特性描述來(lái)考慮，應重新增加新的清單來(lái)補充原項目特性未描述的工作內容，從而發(fā)生不必要的結算糾紛。

措施費調整問(wèn)題：工程量清單計價(jià)方式將措施費分列的目的是不限制投標人的施工方法，投標人在措施項目清單報價(jià)中可根據本企業(yè)的實(shí)際施工組織設計來(lái)計算措施項目，但結算時(shí)清單的工程量與投標時(shí)的工程量往往不一致，工程量的變化，措施費能否調整？如何調整？一直是結算糾紛的重點(diǎn)之一。有的施工合同雖明確注明措施費總價(jià)包干，不作調整，但在實(shí)際施工中如發(fā)生非施工方原因造成的措施費增加（特別是涉及費用較大的情況，如發(fā)現地下文物而增加保護措施）或因設計變更等引起工程量增加很多（如原造三層后改為造四層）造成措施費大幅增加的情況，如措施費不調整，也不合合同雙方平等、公平的原則。