不同的信息系統具有不同的業(yè)務(wù)應用功能，也具有不同的層次結構，但是這些信息系統的結構仍然存在著(zhù)一定的共性。根據系統的組成特點(diǎn)和邏輯功能劃分，信息系統一般具有一個(gè)如下的層次結構：

　　1.安全系統；

　　安全系統是充分采用各類(lèi)安全技術(shù)和防護手段綜合構成的，包括：信息加密、公鑰基礎設施（PKI）、訪(fǎng)問(wèn)控制、身份驗證、入侵監測、病毒防護、物理隔離等多種技術(shù)手段，為信息系統提供安全保障，并最終為信息系統提供各種安全性的應用服務(wù)。安全系統是建立一個(gè)高可靠的信息系統的必要條件。

　　2.系統管理；

　　系統管理涉及網(wǎng)絡(luò )基礎設施、應用支撐系統、業(yè)務(wù)應用系統各個(gè)層面的技術(shù)和運行管理。對于信息系統來(lái)說(shuō)，沒(méi)有科學(xué)的系統管理措施，信息系統不可能得到可靠地運行。系統管理主要包括三個(gè)方面的內容：配置管理、變更管理、資源管理。

　　3.業(yè)務(wù)應用層；

　　業(yè)務(wù)應用層是在應用支撐層上加載和運行的一系列業(yè)務(wù)應用系統。由于信息系統服務(wù)目標的差異，業(yè)務(wù)應用系統的界面、功能和性能存在較大的區別。這些業(yè)務(wù)應用系統可能是公文處理系統、視頻會(huì )議系統、決策支持系統、網(wǎng)上辦公系統、咨詢(xún)業(yè)務(wù)管理系統、客戶(hù)關(guān)系管理系統等。不論這些業(yè)務(wù)應用系統的特性如何，他們都應該滿(mǎn)足系統用戶(hù)的實(shí)際需求，否則就無(wú)法發(fā)揮應有的作用。

　　4.應用支撐層；

　　應用支撐層是面向各個(gè)具體的業(yè)務(wù)應用，構建在網(wǎng)絡(luò )基礎層以及安全系統基礎之上，提供承載最終業(yè)務(wù)應用的支撐。應用支撐層至少可以包含數據庫管理系統、操作系統及中間件等。數據庫管理系統為信息的存儲、檢索和管理提供了基礎性平臺；操作系統為實(shí)現信息系統各項資源的管理提供重要手段；中間件是在計算機硬件和操作系統之上，支持應用軟件開(kāi)發(fā)和運行的系統軟件，它能夠使應用軟件相對獨立于計算機硬件和操作系統平臺，為當今的大型分布式應用搭起了一個(gè)標準的、開(kāi)放的平臺，把分散的系統和技術(shù)組合在一起，實(shí)現大型應用軟件系統的集成。

　　5.網(wǎng)絡(luò )基礎層；

　　網(wǎng)絡(luò )基礎層主要為信息傳遞和資源共享提供高速、方便的信息通道。它不僅包括傳輸系統和硬件資源系統，而且也包括硬件資源的管理系統。

　　6.基礎環(huán)境層；

　　基礎環(huán)境層為信息系統的運行提供一個(gè)可靠的物理環(huán)境，具體包括綜合布線(xiàn)系統、機房系統和部分智能建筑系統等。