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水利工程興建會(huì )對水質(zhì)造成一定影響，水體輸送的距離過(guò)長(cháng)或儲存的時(shí)間過(guò)久會(huì )充分形成復氧過(guò)程，這對環(huán)境容量具有豐富作用，另一方面，水體抬高會(huì )使水流變緩，污染物不易擴散?？偟膩?lái)說(shuō)，建設水利工程對水質(zhì)影響分為正負方面。

正面影響：水體流速變緩．延長(cháng)了滯留時(shí)間，有利于沉降懸浮物，降低水體色度與濁度。同時(shí)，流速緩慢有利于藻類(lèi)活動(dòng)，產(chǎn)生的MgCO與CaCO，沉淀能夠使水體硬度降低，減少水體毒性增加的可能。

負面影響：流速小同時(shí)也會(huì )使水氣界面的交換速率降低，減弱水體復氧能力及自?xún)裟芰?。增大的透明度有利于藻?lèi)進(jìn)行光合作用，大量的繁殖生長(cháng)容易造成水體富營(yíng)養化。而且植被淹沒(méi)會(huì )在消耗水中氧氣的同時(shí)釋放二氧化碳及沼氣，加劇溫室效應，庫底沉積的懸浮物質(zhì)由于長(cháng)期積累，其中的重金屬或有毒物質(zhì)造成污染。另外，河流生態(tài)及流水量的減少會(huì )加劇斷面萎縮，污水排放量增加，使農業(yè)的排灌系統發(fā)生改變，惡化整個(gè)水環(huán)境的質(zhì)量。