1、變壓器各側額定電壓和額定電流各不相等，因此各側電流互感器的型號一定不同，而且各側三相接線(xiàn)方式不盡相同，所以各側相電流的相位有也可能不一致，將使外部短路時(shí)不平衡電流增大，所以變壓器縱差保護的最大系數比發(fā)電機的大，靈敏度相對來(lái)說(shuō)要比較低。

2、變壓器繞組常有調壓分接頭，有的還要求帶負荷調節，使變壓器縱差保護已調整平衡的二次電流又被破壞，不平衡電流增大，這樣將使變壓器縱差保護的最小動(dòng)作電流和制動(dòng)系數都要相應加大。

3、對于定子繞組的匝間短路，發(fā)電機縱差保護完全沒(méi)有作用。變壓器各側繞組的匝間短路，通過(guò)變壓器鐵芯磁路的耦合，改變了各側電流的大小和相位，使變壓器縱差保護對匝間短路有作用。

4、無(wú)論變壓器繞組還是發(fā)電機定子繞組的開(kāi)焊故障，它們的完全縱差保護均不能起到保護作用而動(dòng)作，但變壓器還可以依靠瓦斯保護或壓力保護。

5、變壓器縱差保護范圍除包括各側繞組外，還包含變壓器的鐵心，即變壓器縱差保護區內不僅有電路還有磁路，明顯違反了縱差保護的理論基礎（基爾霍夫電流定律）。而發(fā)電機的縱差保護對象內只有電路的聯(lián)系，在沒(méi)有故障時(shí)，不管外部發(fā)生什么故障，各相電流的矢量和總為零。